Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Otx1P80205 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Otx1P80205 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms