Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms