Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf5P70191 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms