Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ube2kP61087 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms