Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PlnP61014 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PlnP61014 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PlnP61014 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PlnP61014 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms