Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CirbpP60824 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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CirbpP60824 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CirbpP60824 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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