Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcbp1P60335 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcbp1P60335 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms