Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Usp25P57080 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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