Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp5P56399 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms