Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms