Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbp3P49194 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms