Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd1P48410 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms