Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VdrP48281 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VdrP48281 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VdrP48281 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VdrP48281 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms