Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpl5P47962 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl5P47962 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms