Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdkn1bP46414 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms