Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdc2P43407 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdc2P43407 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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