Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LtbP41155 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms