Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ThpoP40226 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ThpoP40226 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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