Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf1P39428 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf1P39428 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms