Protein–RNA interactions for Protein: P35922

Fmr1, Synaptic functional regulator FMR1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmr1P35922 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fmr1P35922 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fmr1P35922 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fmr1P35922 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fmr1P35922 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms