Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprkP35822 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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