Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh15P33146 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms