Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc11P31313 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Hoxc11P31313 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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