Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprmP28828 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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