Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RxrbP28704 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RxrbP28704 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RxrbP28704 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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