Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NapbP28663 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NapbP28663 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NapbP28663 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NapbP28663 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms