Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms