Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb9P28076 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms