Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PdgfraP26618 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PdgfraP26618 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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