Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChgaP26339 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms