Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RarbP22605 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RarbP22605 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RarbP22605 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms