Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm3P21107 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm3P21107 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms