Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb9P20615 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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