Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a2P20490 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a2P20490 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms