Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrkcaP20444 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms