Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfaP20033 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfaP20033 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfaP20033 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PdgfaP20033 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PdgfaP20033 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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