Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Spi1P17433 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spi1P17433 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms