Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra6P16305 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms