Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RaraP11416 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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