Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Hoxd4P10628 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd4P10628 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms