Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
P10404 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
P10404 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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P10404 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
P10404 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P10404 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms