Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl2P10148 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl2P10148 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms