Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CatspereP0DP43 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms