Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P0C1Z5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P0C1Z5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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