Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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LtaP09225 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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LtaP09225 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LtaP09225 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
LtaP09225 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtaP09225 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
LtaP09225 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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