Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-Eb1P04230 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms