Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TcraP01849 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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