Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01787 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P01787 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P01787 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms