Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifnb1P01575 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms