Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sp1O89090 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sp1O89090 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sp1O89090 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sp1O89090 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sp1O89090 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sp1O89090 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sp1O89090 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sp1O89090 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sp1O89090 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms